根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，对于公路客运车辆载客超过额定乘员50%以上的行为，处罚如下：
1. 罚款：根据规定，可处以罚款2000元。
2. 扣分：驾驶证记12分。
3. 刑事责任：如果超载行为严重，可能涉嫌危险驾驶罪，公安机关将依法追究驾驶人的刑事责任。
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